Целью конференции стал обмен опытом, стимулирование междисциплинарных научных исследований, обсуждение современного состояния филогенетики и систематики, взаимосвязи гено- и феносистематики, значения получаемых результатов для реконструкции филогении различных групп живых организмов, разработка методических аспектов и приложений.
Важная задача мероприятия — укрепление существующих и установление новых научных связей для реализации совместных проектов.
В работе конференции приняли участие ведущие отечественные и зарубежные специалисты, кроме того, были представлены пленарные доклады (лекции) приглашенных ученых по ключевым аспектам молекулярной филогенетики.