6 апреля (понедельник) в 13:00 на семинаре кафедры биофизики состоится доклад проф. Крупянского Юрия Федоровича (Федеральный исследовательский центр химической физики им. Н.Н. Семёнова РАН)
Структурная организация ДНК в бактериях.
Различные виды стресса.
Геномная ДНК бактерий взаимодействует с нуклеоид-ассоциированными белками и находится в высоко конденсированной и функциональной форме в нуклеоиде клетки. В активно растущей клетке ДНК организована иерархически с тремя уровнями компактизации ДНК [1]. Такая организация, или очень высокий уровень динамического порядка, критически зависит от потребления энергии, она не может поддерживаться у голодающих бактерий. Архитектура ДНК в покоящихся клетках изучалась с помощью дифракции синхротронного излучения и просвечивающей электронной микроскопии (ПЭМ) [1]. Обнаружены внутриклеточные нанокристаллические, жидкокристаллические и складчатые нуклеосомоподобные структуры ДНК [1]. Далее исследовались изменения в архитектуре ДНК под стрессовым воздействием химического аналога аутоиндуктора анабиоза (4-гексилрезорцина, 4HR) [2]. Повышение концентрации 4HR вызывает переход клеток в анабиотическое покоящееся состояние. Исследования архитектуры ДНК в анабиотическом состоянии указывает на идентичность структуры ДНК в анабиотическом состоянии и в состоянии покоя при стрессе голодания [2]. Далее изучались конденсированные структуры ДНК у бактерий, подвергнутых воздействию антибиотика ципрофлоксацина (CIP). Дифракционная структура спектров после воздействия CIP напоминает структуру спектров для ДНК в клетке в состоянии анабиотического покоя. Был поставлен специальный эксперимент с использованием мутантного штамма Dps. Эксперимент с мутантным штаммом Dps позволяет провести критический анализ моделей упаковки ДНК при различных типах стресса и сделать выводы: пики с разрешением 44.5, 22.2 и 14.8 Å связаны с упорядоченным расположением ДНК. Такой порядок необходимо учитывать в любой дальнейшей модели компактизации ДНК.
- Krupyanskii Y.F. Determination of DNA architecture of bacteria under various types of stress, methodological approaches, problems, and solutions. Biophysical Reviews, 2023, https://doi.org/10.1007/s12551-023-01122-0
- Krupyanskii Yu. F. et al. The Structure of DNA in Anabiotic and Mummified Escherichia coli Cells. Russian Journal of Physical Chemistry B, 2024, Vol. 18, No. 4, pp. 1134–1140. https://doi.org/ 10.1134/S1990793124700441
- Krupyanskii Y. F. et al. Critical Analysis of DNA Packaging Models at Different Types of Stress. Moscow University Biological Sciences Bulletin, 2025, Vol. 80, Suppl. 1, pp. S108–S112. © Allerton Press, Inc., 2025. https://doi.org/10.3103/S0096392525601005
Семинар пройдет в Новой аудитории кафедры биофизики (Ленинские горы, д. 1, стр. 24).
Расписание семинаров и дополнительная информация на сайте https://www.biophys.msu.ru/seminar
Контакты:
- сайт: https://www.biophys.msu.ru
- e-mail: knox@biophys.msu.ru
- тел: +7 (495) 939-12-38
